（一）办公室（政工人事科）。负责局机关日常运转，承担保密、档案、信访、督查、新闻宣传、政务公开、综合协调、后勤保障等工作。承担综合性文稿的组织起草和有关规范性文件的审核工作，承担各类会议的组织安排、纪要起草和会议议定事项的督查督办工作。负责办理人大代表建议、政协委员提案和有关行政复议、行政应诉等工作。负责局机关干部人事、机构编制和教育培训工作。负责局机关党建和群团工作，承担局机关退休人员服务管理工作。
（二）思想政治工作科(德育卫生安全艺术教育科、团教工委)。负责指导各级各类学校思想政治、意识形态、精神文明建设和校外教育工作，指导教育、体育系统群团工作和思想政治工作队伍建设。指导全市各级各类学校德育、美育、劳动教育、卫生与健康教育、国防教育和学生军训工作，会同有关部门指导学校食品安全、疾病防控等卫生安全工作。负责组织全市学生体质健康、艺术素养等调查和监测工作，组织管理各类艺术交流活动。负责全市中小学综合实践活动的组织、协调和服务保障工作。负责教育、体育领域稳定和安全生产工作，监督指导各级各类学校公共安全和应急处置工作，指导学校安全教育和学生预防违法犯罪工作，组织开展校园网络安全监管工作。承担团教工委、教育系统关心下一代工作委员会日常工作，协调教育系统妇女儿童工作。
（三）基础教育科。负责拟订基础教育（含学前教育、特殊教育）事业发展规划，指导全市基础教育（含学前教育、特殊教育）改革与发展和教育标准化建设工作。负责拟定学生管理政策，制订基础教育（含学前教育、特殊教育）阶段的招生计划，承担各级各类教育的学籍管理和双语教育工作。负责基础教育（含学前教育、特殊教育）学校图书和教学仪器设备的配备工作，承担义务教育、高中教育、学前教育和特殊教育的宏观管理和指导工作，监督实施国家、自治区课程设置方案、课程标准和各级各类学校教学用书管理工作。负责教育领域合作交流与教育受援工作，承担内地西藏班相关工作。负责教育系统普法领导小组办公室日常工作。
（四）职业教育与成人教育科。负责落实职业教育政策，承担职业教育的宏观管理和指导工作，推进现代职业教育体系和终身教育体系建设。负责统筹指导继续教育和民办教育工作，承担扫除青壮年文盲工作。负责协助教育厅做好全市内地西藏中职班招生录取工作和中转接送工作。负责职业教育技术装备建设，承担教育扶贫相关工作。
（五）教师工作科。承担全市教育系统人才队伍建设工作，负责全市教师管理工作，协助人社部门指导各级各类学校岗位设置工作，组织指导师德师风建设、教师培养、培训和考核工作，承担全市教师资格认定和教育系列专业技术职务评聘工作。负责教师队伍管理信息化建设工作，采集和汇总全市教职工基础数据信息。负责全市教育系统教职工人事、机构编制、劳动工资和教育培训工作。负责学校党建工作，承担教育系统退休人员服务管理工作，协助做好教育人才援藏工作。
（六）教育督导办公室。贯彻执行国家、自治区教育督导政策，拟订本市教育督导政策，组织实施教育督导工作。负责市人民政府教育督导委员会的日常工作。根据全市实际制定教育督导工作计划和督导评估方案、措施。负责对全市推进义务教育均衡发展、教育质量监测及素质教育工作等进行督导评估。协助对社会关注的热点、难点问题进行专项督导检查。指导下级教育督导工作，组织培训督导人员，承担教育督导队伍建设。向市人民政府和教育督导委员会报告工作，反映情况，提出建议。
（七）财务科（教育工会）。负责落实教育、体育经费政策，编制教育、体育事业经费预算，审核所属单位经费预算和决算，组织开展教育、体育系统内部审计工作，指导全市学生资助工作。负责机关和所属单位财务、国有资产管理工作。负责局机关劳动工资工作，承担全市教育基本信息统计、分析、审核、上报工作。负责教育工会日常工作。
（八）体育科。负责拟订全市体育发展规划，指导全市体育训练、竞赛和运动员队伍建设工作，推行国民体质监测制度。指导全市各级各类学校体育工作，负责全市各级各类学校体育考试工作，指导开展群众性体育活动，组织开展全市重大体育赛事工作，承担参加全区性竞技比赛和全区综合性运动会的组织工作。负责指导体育基础设施建设，承担体育彩票发行和规范体育服务管理工作。负责体育领域合作交流与体育受援工作。